中新網(wǎng)重慶11月23日電 (記者 鐘旖)記者23日從西南大學資源昆蟲高效養(yǎng)殖與利用全國重點實驗室獲悉，數(shù)字家蠶該實驗室代方銀教授團隊日前正式上線“數(shù)字家蠶”共享分析平臺(SilkMeta)。共享作為迄今涵蓋數(shù)據(jù)類型最全、分析放ayx愛游戲官方數(shù)據(jù)量最大的平臺家蠶組學數(shù)據(jù)庫，面向全球科學家開放。上線

　　據(jù)介紹，全球“數(shù)字家蠶”共享分析平臺(SilkMeta)全稱為“家蠶泛基因組和多組學數(shù)據(jù)分析平臺”，科學整合了家蠶泛基因組及多組學數(shù)據(jù)，家開將具有上千個種質(zhì)資源的數(shù)字家蠶線下實體基因資源庫，轉(zhuǎn)化為組學序列線上數(shù)據(jù)庫，共享實現(xiàn)“數(shù)據(jù)共享”。分析放這也是平臺繼2022年該團隊發(fā)布家蠶超級泛基因組圖譜后，中國科學家推動創(chuàng)建“數(shù)字家蠶”取得的上線ayx愛游戲官方又一重大進展。

圖為“數(shù)字家蠶”共享分析平臺(SilkMeta)頁面。全球西南大學供圖

　　代方銀介紹，科學在現(xiàn)代蠶學研究和育種實踐中，家蠶泛基因組及多組學數(shù)據(jù)已經(jīng)成為科學家手里不可或缺的基礎資源，合理使用可大大縮短研究和育種的時間，顯著提高工作效率。但這些數(shù)據(jù)的分析利用，對一般用戶來講，具有較高的技術壁壘，成本也很高。

　　“我們可以把‘數(shù)字家蠶’共享分析平臺比喻為一部智能、高效的家蠶基因‘數(shù)字字典’或‘超級圖書館’，研究人員能在這里快速獲取家蠶基因組相關信息。”實驗室博士后陸昆鵬表示，平臺整合了家蠶泛基因組、轉(zhuǎn)錄組、變異組、表型組等多組學數(shù)據(jù)和功能基因研究數(shù)據(jù)，并提供開展比較基因組和功能基因組等方面研究的分析工具。目前，平臺已涵蓋豐富的數(shù)據(jù)內(nèi)容，包括1082個二代測序基因組、546個三代測序基因組、5000多萬個基因組變異、1168個轉(zhuǎn)錄組、294種家蠶質(zhì)量性狀基因型特征、123個非編碼RNA測序數(shù)據(jù)以及單細胞轉(zhuǎn)錄組、甲基化測序數(shù)據(jù)、免疫共沉淀測序數(shù)據(jù)等。

　　2022年10月，代方銀團隊完成家蠶大規(guī)模種質(zhì)資源基因組解析，成功繪就世界上首張家蠶超級泛基因組圖譜，率先實現(xiàn)家蠶基因庫數(shù)字化，創(chuàng)建“數(shù)字家蠶”。此次“數(shù)字家蠶”共享分析平臺的上線，代表著西南大學家蠶基因研究從“技術領跑”轉(zhuǎn)變?yōu)椤皵?shù)據(jù)共享”，全球科學家都能在該平臺獲得基因數(shù)據(jù)，實現(xiàn)種質(zhì)資源基因組、遺傳變異及表型的開放共享和可視化、便利化分析。

　　“這是我們發(fā)展道路上里程碑式的成果，希望通過數(shù)據(jù)共享，進一步推動家蠶基因研究，讓人與自然協(xié)調(diào)發(fā)展。”中國工程院院士、西南大學蠶學與系統(tǒng)生物學研究所所長向仲懷表示。(完)